大靖年间沧溟海沿线倭患屡禁不止，定海将军沈氏满门被扣上通倭罪名，一夜之间尽数殉国，唯独嫡女沈长宁被老部下调包救下侥幸逃生。她隐姓埋名混进沿海走商船队当船医，靠着自小学的水文本事和家传医术站稳脚跟，暗地搜寻当年沈家被构陷的实证。 途中她偶遇奉旨暗查海防贪腐的靖海侯世子陆珩，起初两人互相提防试探，一路共历倭船截杀、黑市追凶后渐生信任，才发现沈家冤案背后牵扯着沿海官绅勾结倭寇、私吞海防饷银的窝案。两人联手集齐证据直递御前，最终洗清沈家冤屈、整肃沿海水师，沈长宁也卸下家仇重担，留在海疆辅佐整饬海防，守得沧溟海沿线真正的沧海长宁。
