1954年，联邦警官泰迪与搭档查克乘船前往波士顿港外的禁闭岛，调查一桩离奇失踪案。岛上坐落着一座专门关押精神病罪犯的监狱，一名亲手杀害自己三个孩子的女犯蕾切尔从密闭牢房中神秘消失，仿佛人间蒸发。泰迪在调查过程中发现，监狱主治医师考利似乎刻意阻挠，病人们的证词也充满矛盾。更令人不安的是，泰迪向查克坦白，他此行的真正目的是寻找当年纵火烧死他妻子的管理员，并揭露政府利用精神病人进行残忍的人体实验的阴谋。随着调查深入，泰迪开始出现剧烈头痛和幻觉，亡妻不断出现在梦境中，岛上的一切都变得诡异离奇。当他终于抵达灯塔，准备直面真相时，却被告知一个令人震惊的事实——他并非真正的联邦警官，而是禁闭岛上的病人，曾亲手杀害了患有躁郁症并溺死三个孩子的妻子。考利医生和查克（实为主治医师希恩）精心策划了这场角色扮演，试图唤醒他封存的记忆。面对无法承受的真相，泰迪最终选择接受脑叶切除手术，宁愿“像一个好人那样死去”，也不愿带着罪恶的记忆继续活着。
